基于COⅠ基因和D—loop序列的东海鳓鱼种质资源遗传变异研究

作者:admin 来源:未知 点击数: 发布时间:2019年08月24日

  基于COⅠ基因和D—loop序列的东海鳓鱼种质资本遗传变异研究_生物学_天然科学_专业材料。第3 2卷 第 2期 2 0 1 3年 3月 浙江海洋学院学报( 自 然科 学版) J o u r n a l o f Z h e j i a n g O c e a n

  第3 2卷 第 2期 2 0 1 3年 3月 浙江海洋学院学报( 自 然科 学版) J o u r n a l o f Z h e j i a n g O c e a n U n i v e r s i t y ( N a t u r a l S c i e n c e ) V 0 1 . 3 2 No . 2 Ma r . . 2 Ol 3 文章 编 号: 1 0 0 8 — 8 3 0 X( 2 0 1 3 ) 0 2 — 0 0 9 3 — 0 6 基于 C O I 基 因和 D — l o o p序 列 的东海鳓 鱼 种质资本遗传变 异研 究 飞 ,贺舟挺 , 徐开达 , 白文斌 ,薛利 建 ,张响亮 ( 浙江海 洋学 院海洋 与渔业研究所 ,浙江省海 洋水产研究所 , 浙江舟山 3 1 6 1 0 0 ) 摘 要: 以东海区鳓鱼 背部肌 肉的线粒体 D N A作为模板 , 对1 6 个个 体的 C O I 基 因和 D — l o o p 序列进行 了扩增 , 通过对 P C R产品进行双 向测序 ,最终 获得了 6 9 1 b p的 c O I 基 因片段和 7 1 8 b D的 D — l o o p序 列片段。用 D N A S P软件 阐发得知 , 1 6 个C O I 基 因序列定义 了 6个单倍 型( 在G e n B a n k登录号 : HM 0 3 0 7 6 5 一 HM0 3 0 7 6 8 , HM 0 3 0 7 6 9 一 HM0 3 0 7 7 0 ) , 在6 个单倍 型中 , 共检测到 6个变异位点 , 其 中有 5个变异位点发生在第三暗码子位置上 , 有1 个 变异 位点 发生在第一暗码子位置上。东海区 鳓鱼 1 6个 个 体 D— l o o p序 列 共 定 义 了 1 4个 单 倍 型 ( G e n B a n k登 录 号 : H M0 3 0 7 8 1 , HM 0 3 0 7 8 3 一 HM 0 3 0 7 9 2 , H M0 3 0 7 9 4 一 H M0 3 0 7 9 6 ) 。除去插人/ 缺失位点 , l 4个单倍 型共检测到 3 O个多态位点 , 次要发生在 D - l o o p序列 的两头区域 ; D — l o o p序列还 检测到 8 0 个插 入或缺失位点 , 碱基插入次要发生在 3 4 0 ~ 4 1 9 b p之 间的地方 区域 , 以4 O b p反复片段插入的形式进行。每个 个别含有 2 - 4 个 持续反复 片段 。对鳓鱼进行 了遗传多样性阐发 , C O I 基 因序列 的单倍型多样性为 0 . 6 1 7 , 核苷酸多样性指数 为0 . 0 0 1 3 7 , 平均核苷酸差别数为 O . 9 5 0 。 D — l o o p 序列 的单倍型多样性为 O . 9 8 3 , 核苷酸多样性指数为 0 . 0 0 9 9 8 , 平均核苷酸差 异数为 6 . 3 6 7 。分析阐发 , 东海区鳓鱼的遗传多样性 并不高 , 有需要采纳分析办法对其进行种质资本庇护。 环节词 : 东海 ; 鳓鱼 ; c O I 基因 ; D — l o o p 序列 ; 种质 资本 ; 遗传变异 中图分类号 : Q3 1 文献标识码 :A Ge n e t i c Di v e r s i t y o f l l i s h a e l o n g a t a i n t h e Ea s t Ch i n a S e a Re v e a l e d b y CO I a n d D- l o o p S e q u e n c e LI Pe n g - f e i ,HE Z h o u - t i n g ,XU Ka i — d a , e t a l ( M a r i n e a n d F i s h e r y R e s e a r c h I n s t i t u t e o f Z h e j i a n g O c e a n U n i v e r s i t y , Ma r i n e F i s h e r i e s R e s e rc a h I n s t i t u t e o f Z h e j i a n g P r o v i n c e , Z h o u s h a n 3 1 6 1 0 0 , C h i n a ) A b s t r a c t :M i t o c h o n d r i a l D N A( mt D N A )o f l l i s h a e l o n g a t a w a s p r e p a r e d a s t e mp l a t e s f r o m t h e i r b a c k mu s c l e . T h e P CR t e c h n i q u e wa s u s e d t o a mp l i f y t h e mt DNA CO I g e n e a n d D- l o o p s e q u e n c e i n 1 6 i n d i v i d u a l s o f e l o n g a t a c o l l e c t e d f r o m t h e 1 8 4 a n d 1 8 5 s e a

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